RM8461用于蛋白質組學的人肝臟標準品(NIST)

RM8461用于蛋白質組學的人肝臟標準品(NIST)旨在支持復雜樣品中肽和蛋白質鑒定的研究，例如基于質譜的蛋白質組學中的那些。 RM 8461 可用于幫助評估實驗室內肽和蛋白質鑒定的可信度或實驗室之間或不同測量方法之間的可比性。 RM 8461 還可用于開發和驗證用于識別肽和蛋白質的新研究方法。

描述：

一個 RM 8461 單元由一個裝有約 0.5 克凍干人肝材料的小瓶組成。

非認證值：

生產 RM 8461 是為了提供復雜的人體組織樣本，用于評估與液相色譜 (LC) 耦合的蛋白質組學質譜儀器的性能、蛋白質和肽鑒定軟件以及樣品制備方法的開發 [1 ]。選擇肝組織以提供“標準化"范圍的蛋白質豐度并提供樣本復雜性以覆蓋色譜“空間"。非認證值不提供對國際單位制 (SI) 或其他高階參考系統的計量溯源性 [2]。 RM 8461 中存在的已鑒定蛋白質的未經認證的定性值在表 1 中作為 UniprotKB [3] 登錄號列出。

儲存：RM8461用于蛋白質組學的人肝臟標準品(NIST) 應儲存在受控的室溫（20 °C 至 25 °C）下，避免陽光直射，直至需要。

使用：在取出測試部分進行分析之前，應*混合內容物。建議使用等于或大于 1 mg 的分析測試部分。

分析：對于蛋白質特性等定性測量，不能使用符合 JCGM GUM 的測量不確定度的常規評估和表達。表 1 列出了使用鑒定算法建立的 1619 種蛋白質的身份，其可靠性得到該領域專家的普遍認可。 RM 8461 中鑒定的蛋白質是使用多個搜索引擎和多種樣品制備方法從自下而上的蛋白質組學分析中推斷出來的。從 8 罐 RM 8461 的單個 1 mg 制劑 (n = 3) 中過濾出常見的蛋白質，并重復注射 (n = 3)。僅當滿足以下條件時才包含蛋白質：

• 錯誤發現率 (FDR) 低于 5 %，

• 整個測量組的光譜豐度優于 20% CV（包括技術和工藝重復分析），

• 在RM 8461 的整個生產過程中，使用Sequest HT、Mascot、MSAmanda 和Byonic 算法從八個罐子的分層隨機抽樣中鑒定出至少三種*的肽。

NIST 確信表 1 中列出的 1619 種蛋白質的非認證定性值符合所有標準。